Population structure of the Atlantic seabob shrimp Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) based on geometric morphometrics / Estructura de la población del camarón langostino del atlántico Xiphopenaeus kroyeri (Heller, 1862) basada en morfometría geométrica

SUMMARY: In 2004, Xiphopenaeus kroyeri, one of major species in commercial fisheries in Brazil was included in the list of brazilian overfished species and, in 2006, two cryptic species were identified in the Atlantic Ocean by molecular approaches: Xiphopenaeus sp. I and II. In 2019, Carvalho-Batista et al. described both Xiphopenaeus sp. I and Xiphopenaeus sp. II and these species were named X. kroyeri and X. dincao, respectively. This study aimed at performing morphometric analysis in order to identify potential fishing stocks of X. kroyeri sensu strictum along Brazilian coast. The results obtained separate Caravelas, Atafona and Balneário Camboriú from all the other populations studied and showed three groups: Ubatuba, Nova Almeida; Ubatuba, Cananéia; Ubatuba, Santos. These results indicate that the maritime limits practiced in closed seasons along Brazil are embracing the detected morphometric stock boundaries observed for Xiphopenaeus kroyeris.s.

RESUMEN: En 2004, Xiphopenaeus kroyeri, una de las principales especies de la pesca comercial en Brasil, fue incluida en la lista de especies brasileñas sobre explotadas y, en 2006, se identificaron dos especies crípticas en el Océano Atlántico mediante enfoques moleculares: Xiphopenaeus sp. I y II. En 2019, Carvalho-Batista et al. describieron tanto Xiphopenaeus sp. I y Xiphopenaeus sp. II y a estas especies denominaron X. kroyeri y X. dincao, respectivamente. Este estudio tuvo como objetivo realizar un análisis morfométrico con el fin de identificar posibles poblaciones de pesca de X. kroyeri sensu strictum a lo largo de la costa brasileña. Los resultados obtenidos en Caravelas, Atafona y Balneário Camboriú se separaron de todas las demás poblaciones estudiadas y mostraron tres grupos: Ubatuba, Nova Almeida; Ubatuba, Cananéia; Ubatuba, Santos. Estos resultados indican que los límites marítimos practicados en temporadas de veda a lo largo de Brasil están abarcando los límites de stock morfométricos observados para Xiphopenaeus kroyeris.s.

Floristic composition, structure and environmental characterization of Cyathea costaricensis population in a remnant cloud forest in Mexico / Composición florística, estructura y caracterización ambiental de una población de Cyathea costaricensis en un relicto de bosque mesófilo de montaña en México

Abstract Introduction: Tree ferns are significant components of temperate, tropical and subtropical forests, contributing to shape complex forest stand structures. Objectives: 1) to describe the population structure of Cyathea costaricensis in a remnant cloud forest of West-central Mexico; 2) to characterize and relate the floristic composition and the structure of the most important tree species associated to the C. costaricensis population and; 3) to describe the environment where C. costaricensis occurs. Methods: We estimated the Importance Value Index (IVI) to select the most important canopy-dominant species associated to C. costaricensis; we constructed height and Diameter at Breast Height (DBH) frequency distributions for those selected species according to IVI as well as for C. costaricensis population; we computed the asymmetry of the frequency distributions through the coefficient of skewness and the probability density function via the Kernel density estimation. We tested for differences between canopy-dominant tree species and C. costaricensis population structure by the non-parametric Wilcoxon rank sum test. Results: C. costaricensis individuals presented the smallest heights and intermediate DBH sizes as compared with the canopy-dominant species, with statistically significant differences for height but not for DBH according to the Wilcoxon test. Most of the tree fern individuals were located in uneven terrains and over the base slope of the terrain; canopy openness and Total Radiation Under the Canopy values were similar to those reported for Cyathea species elsewhere. Conclusions: We confirm the hypothesis of comparable structure between the canopy-dominant species and the C. costaricensis population only for DBH; on the contrary, for trunk height, there were statistically significant differences; the small heights of C. costaricensis suggest their coexistence in the understory through sheltering from the taller canopy-dominants. Mostly all individuals of C. costaricensis were confined to local environmental conditions, particularly to physiography.

Resumen Introducción: Los helechos arborescentes son componentes importantes de los bosques templados, tropicales y subtropicales, que contribuyen a dar forma a rodales de estructuras complejas. Objetivos: 1) Describir la estructura poblacional de Cyathea costaricensis en un remanente de bosque nuboso del centro-oeste de México; 2) Caracterizar y relacionar la composición florística y la estructura de las especies arbóreas más importantes asociadas a la población de C. costaricensis y; 3) Describir el ambiente donde se encuentra C. costaricensis. Métodos: Estimamos el Índice de Valor de Importancia (IVI) para seleccionar las especies dominantes más importantes del dosel asociadas a C. costaricensis; para las especies seleccionadas según IVI, construimos distribuciones de frecuencia de alturas y diámetros a la altura del pecho (DAP), así como para la población de C. costaricensis. Calculamos la asimetría de las distribuciones de frecuencia a través del coeficiente de asimetría y la función de densidad de probabilidad mediante la estimación de densidad de Kernel. Probamos las diferencias entre las especies de árboles dominantes en el dosel y la estructura de la población de C. costaricensis mediante la prueba no paramétrica de suma de rangos de Wilcoxon. Resultados: los individuos de C. costaricensis presentaron las menores alturas y tamaños intermedios de DAP en comparación con las especies dominantes del dosel, con diferencias estadísticamente significativas para la altura, pero no para el DAP según la prueba de Wilcoxon. La mayoría de los individuos de helechos arborescentes se ubicaron en terrenos irregulares y sobre la pendiente baja del terreno. Los valores de apertura del dosel y Radiación total bajo el dosel fueron similares a los reportados para las especies de Cyathea en otros lugares. Conclusiones: Confirmamos la hipótesis de que hay una estructura similar entre las especies dominantes del dosel y la población de C. costaricensis solo para el DAP; por el contrario, para la altura del fuste, hubo diferencias estadísticamente significativas; las pequeñas alturas de C. costaricensis sugieren su coexistencia en el sotobosque a través de la cobertura árboles dominantes del dosel. La mayoría de los individuos de C. costaricensis fueron encontrados confinados a condiciones ambientales locales, en particular a la fisiografía.

Evaluation of the Romosinuano cattle population structure in Mexico using pedigree analysis / Evaluación de la estructura poblacional de bovinos Romosinuano en México mediante el análisis de pedigrí / Avaliação da estrutura populacional de bovinos Romosinuano no México usando análise de pedigree

Abstract Background: Romosinuano cattle breed in Mexico has endured isolation and it is necessary to characterize it in order to facilitate sustainable genetic management. Objective: To assess the evolution of the structure and genetic diversity of the Romosinuano breed in Mexico, through pedigree analysis. Methods: Pedigree data was obtained from Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). The ENDOG program (4.8 version) was used to analyze two datasets, one that includes upgrading from F1 animals (UP) and the other with only straight-bred cattle (SP). For both datasets, three reference populations were defined: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2), and 2010-2017 (RP3). The pedigree included 3,432 animals in UP and 1,518 in SP. Demographic parameters were: Generation interval (GI), equivalent number of generations (EG), pedigree completeness index (PCI), and gene flow among herds. Genetic parameters were: Inbreeding (F) and average relatedness (AR) coefficients, effective population size (Nec), effective number of founders and ancestors, and number of founder genome equivalents. Results: The GI varied from 6.10 to 6.54 for UP, and from 6.47 to 7.16 yr for SP. The EG of the UP and SP improved >63% from RP1 to RP3. The PCI increased over time. No nucleus or isolated herds were found. For RP3, F and AR reached 2.08 and 5.12% in the UP, and 2.55 and 5.94% in the SP. For RP3, Nec was 57 in the UP and 45 in the SP. Genetic diversity losses were attributed mainly (>66%) to genetic drift, except for RP3 in the SP (44%). Conclusions: A reduction of the genetic diversity has been occurring after the Romosinuano breed association was established in Mexico, and this is mainly due to random loss of genes.

Resumen Antecedentes: La raza bovina Romosinuano ha estado prácticamente aislada en México y requiere ser caracterizada para un manejo genético sostenible. Objetivo: Evaluar la evolución de la estructura y diversidad genética de la raza Romosinuano en México, mediante el análisis del pedigrí. Métodos: Los datos genealógicos provinieron de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). Los análisis se realizaron con el programa ENDOG (versión 4.8) para dos bases de datos, una que incluyó animales en cruzamiento absorbente (UP) a partir de F1 y la otra con sólo animales puros (SP). Para ambas bases de datos se definieron tres poblaciones de referencia: 1998-2003 (RP1), 2004- 2009 (RP2), y 2010-2017 (RP3). El pedigrí incluyó 3.432 animales en la UP y 1.518 en la SP. Los parámetros demográficos fueron: intervalo generacional (GI), número de generaciones equivalentes (EG), índice de completitud del pedigrí (PCI), y flujo de genes entre hatos. Los parámetros genéticos fueron: coeficientes de consanguinidad (F) y de relación genética aditiva (AR), tamaño efectivo de la población (Nec), número efectivo de fundadores y ancestros, y número equivalente de genomas fundadores. Resultados: El GI varió de 6,10 a 6,54 para la UP, y de 6,47 a 7,16 años para la SP. El EG de la UP y la SP mejoró >63%, de RP1 a RP3. El PCI aumentó a través de los años, pero más para la SP que para la UP. No se encontraron hatos núcleo o aislados. Para RP3, F y AR alcanzaron 2,08 y 5,12% en la UP, y 2,55 y 5,94% en la SP. Para RP3, Nec fue 57 en la UP y 45 en la SP. Más de 66% de las pérdidas en diversidad genética se debieron a deriva genética, excepto para RP3 en la UP (44%). Conclusiones: una reducción de la diversidad genética ha estado ocurriendo después de que se formó la asociación de criadores de ganado Romosinuano en México, y es debida principalmente a pérdidas aleatorias de genes.

Resumo Antecedentes: A raça bovina Romosinuano tem estado praticamente isolada no México e precisa ser caracterizada para um manejo genético sustentável. Objetivo: Avaliar a evolução da estrutura e diversidade genética da raça Romosinuano no México, através da análise de pedigree. Métodos: Os dados genealógicos vieram da Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). As análises foram feitas com o programa ENDOG (versão 4.8) para duas bases de dados, uma que incluiu animais em cruzamento absorvente (UP) a partir da F1 e a outra base de dados somente com animais puros (SP). Para ambas bases de dados foram definidas três populações de referência: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2) e 2010-2017 (RP3). O pedigree incluiu 3.432 animais na UP e 1.518 na SP. Os parâmetros demográficos foram: intervalo entre gerações (GI), número de gerações equivalentes (EG), índice de completude do pedigree (PCI), e fluxo de genes entre rebanhos. Os parâmetros genéticos foram: coeficiente de consanguinidade (F) e da relação genética aditiva (AR), tamanho efetivo da população (Nec), número efetivo de fundadores e ancestrais, e número equivalente de genomas fundadores. Resultados: O GI variou de 6,10 a 6,54 para a UP, e de 6,47 a 7,16 anos para a SP. EG da UP e a SP melhorou >63%, de RP1 a RP3. O PCI aumentou ao longo dos anos, mas mais para a SP do que para o UP. Não se encontraram rebanhos núcleo ou isolados. Para RP3, F e AR alcançaram 2,08 e 5,12% na UP, e 2,55 e 5,94% na SP. Para RP3, Nec foi 57 na UP e 45 na SP. Mais de 66% das perdas em diversidade genética foram ocasionadas pela deriva genética, exceto para RP3 no UP (44%). Conclusões: Depois que a associação da raça Romosinuano foi estabelecida no México, tem ocorrido uma redução da diversidade genética, principalmente devido a perdas aleatórias de genes.

ESBL-producing-multidrug resistant E. coli population from urinary tract infections is less diverse than non-ESBL-multidrug resistant population.

OBJECTIVE: The aim of this study was to compare the population structure of three different representative groups of E. coli isolates causing urinary tract infections in a large area of Madrid, Spain: two groups of multidrug resistant isolates (MDR), ESBL- and non-ESBL producers, and one of fully-susceptible isolates (35 isolates in each group). METHODS: Epidemiological relatedness was studied by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and multilocus sequence typing (MLST). The presence of genes encoding ESBL was determined by using PCR and sequencing. Antimicrobial susceptibility testing was performed by broth microdilution. RESULTS: PFGE analysis revealed a high degree of genetic diversity in susceptible and non-ESBL-MDR groups. However, the ESBL-MDR E. coli population was less diverse and a large cluster consisting of ST131 and CTX-M-15-producing isolates was detected. CONCLUSIONS: The present study revealed that ESBL-producing-MDR E. coli population was less diverse than the non-ESBL MDR group and that ST131 was dominant among CTX-M-15-producing isolates that reflects the spread of this successful MDR lineage.

Effects of urbanization on the population structure of freshwater turtles across the United States.

Landscape-scale alterations that accompany urbanization may negatively affect the population structure of wildlife species such as freshwater turtles. Changes to nesting sites and higher mortality rates due to vehicular collisions and increased predator populations may particularly affect immature turtles and mature female turtles. We hypothesized that the proportions of adult female and immature turtles in a population will negatively correlate with landscape urbanization. As a collaborative effort of the Ecological Research as Education Network (EREN), we sampled freshwater turtle populations in 11 states across the central and eastern United States. Contrary to expectations, we found a significant positive relationship between proportions of mature female painted turtles (Chrysemys picta) and urbanization. We did not detect a relationship between urbanization and proportions of immature turtles. Urbanization may alter the thermal environment of nesting sites such that more females are produced as urbanization increases. Our approach of creating a collaborative network of scientists and students at undergraduate institutions proved valuable in terms of testing our hypothesis over a large spatial scale while also allowing students to gain hands-on experience in conservation science.

Genetic variation and genetic structure of Caranx hippos (Teleostei: Carangidae) in the Colombian Caribbean / Variación y estructura genética de Caranx hippos(Teleostei: Carangidae) en el Caribe de Colombia

Abstract The crevalle jack Caranx hippos, has a wide distribution in the Western Atlantic, becoming one of the most economically important species in the artisanal fishing industry in Colombia. However, little is known about its biology. The present study aimed to evaluate the variation and genetic structure of C. Hippos in the Colombian Caribbean by analyzing the mitochondrial DNA region control and cytochrome oxidase subunit (COI). We sequenced the DNA of 153 muscle samples collected from specimens obtained from six fishing ports. The results showed 21 haplotypes for COI and 116 haplotypes for the control region, divided into two lineages that do not exhibit a pattern of geographical distribution. For mitochondrial control region, the estimated haplotype diversity (Hd) presented relatively high values (Hd= 0.99 and = 0.1), while for COI results were Hd = 0.68 and = 0.01; the relationship between haplotype and nucleotide diversity and the neutrality test revealed that C. Hippos experienced bottlenecking and a subsequent rapid population expansion. Estimates of genetic structure were low and insignificant, indicating no differentiation between samples collected from geographical isolation. This suggests that for the Colombian Caribbean there is a panmictic population of C. hippos. However, variations were found at population levels, especially in La Guajira, Turbo and San Antero, which, when compared to those included for Brazil and México, demonstrated that unique haplotypes in La Guajira are more aligned to the Brazilian populations, by means of the influence of the Caribbean Current, whilst those from Turbo and San Antero are more frequent in haplotypes originating from Mexico. Future studies should focus the understanding of these processes. Rev. Biol. Trop. 66(1): 122-135. Epub 2018 March 01.

Resumen El jurelCaranx hipposes considerado una de las principales especies objeto de la pesquería artesanal en aguas colombianas; sin embargo, es poco lo que se conoce respecto a su estructura poblacional. El presente estudio propuso evaluar la variación y estructura genética en el Caribe colombiano a partir del análisis de la región control y la subunidad citocromo oxidasa I (COI) del ADN mitocondrial. Secuenciamos el ADN de 153 muestras de músculo recolectadas de ejemplares desembarcados en seis puertos pesqueros. Los resultados mostraron 21 haplotipos para COI y 116 haplotipos para la región control, distribuidos en dos linajes que no presentan un patrón de distribución geográfica. Para la región control la diversidad genética fue alta (Hd=0.99 y π = 0.1), mientras que para COI los resultados fueron Hd=0.68 y π =0.01, esto mostró que probablemente C. hipos pasó por un evento que provocó la disminución drástica de la población y posteriormente tuvo un crecimiento rápido. Las estimaciones del grado de estructuración genética fueron bajas y poco significativas indicando la ausencia de diferenciación entre las muestras recolectadas a partir de un aislamiento geográfico, esto sugiere que la población de C. hipos es panmictica; sin embargo, se hallaron variaciones a nivel intrapoblacional especialmente en La Guajira, Turbo y San Antero, los cuales al ser comparados con los haplotipos incluidos de Brasil y México se encontró que el único haplotipo hallado en La Guajira está alineado con el de Brasil, facilitado probablemente por la corriente del Caribe, mientras que los de Turbo y San Antero con los de México.

Ecología poblacional de Cittarium pica (Gastropoda: Trochidae) de San Andrés Isla, Reserva Internacional de Biósfera, Seaflower / Population ecology of Cittarium pica (Gastropoda: Trochidae) of San Andrés Island, International Biosphere Reserve, Seaflower

Resumen Cittarium pica es un gasterópodo conspicuo de los litorales rocosos del Caribe. Dada su importancia en la dieta de las comunidades del Caribe, éste ha sido sobrexplotado, incluso en algunos lugares se ha extinguido, por lo cual algunos países lo han incluido dentro de la lista roja de invertebrados marinos. En la isla de San Andrés Colombia la pesca es artesanal y no tiene regulaciones, conllevando a una disminución de su población. Teniendo en cuenta la importancia socioeconómica, cultural y ecológica de C. pica, así como su grado de vulnerabilidad a la extinción, es urgente desarrollar acciones de manejo que incrementen la resiliencia de la especie y el sostenimiento del recurso. Para evaluar el estado de la población de C. pica de la isla, se estimó la estructura por talla y por sexo, talla de maduración, y los parámetros de crecimiento a partir del análisis de datos de frecuencia de tallas. De septiembre a diciembre 2013 y de enero a marzo 2014, se recolectaron al azar 458 ejemplares en ocho estaciones representativas del litoral rocoso de la isla. Se midió el diámetro de la base de la concha, se determinó el sexo y el tamaño mínimo de maduración. El 80 % de la población consistió de individuos pequeños < 25.5 mm. La proporción de sexos fue de 1:1, excepto en noviembre y el tamaño mínimo de inicio de la madurez para sexos combinados fue de 14.07 mm. Los parámetros de von Bertalanffy K (0.730 año-1), L∞ (110.78 mm) y Φ (3.95) son mayores respecto a otras poblaciones del Caribe. La mortalidad total fue de 3.39 año-1, la mortalidad natural y por pesca fue de 1.02 año-1 y 2.36 año-1, respectivamente. El máximo reclutamiento se estimó para junio y la tasa de explotación máxima entre 0.563 y 0.640, para tamaños de captura de 40 y 50 mm. La tasa de explotación se estimó en 0.70, lo que sugiere una fuerte presión sobre el recurso. Por lo anterior, se recomienda vedar por completo la captura manual de C. pica hasta que un monitoreo evidencie que la población se recupera en la isla.

Abstract Cittarium pica is a conspicuous gastropod of the rocky coastlines of the Caribbean. Given its importance in the diet of Caribbean communities, it has been over-exploited, even reaching extinction in some places, and the species has been included in the red lists of marine invertebrates in some countries. Its fishery in San Andres Island-Colombia is artisanal without any regulation, leading to a decrease in its population. Taking into account the socio-economic, cultural and ecological importance of C. pica and its vulnerability to extinction, it is urgent to develop management actions directed to increase the resilience of the species and its sustainability as a fishery resource. To assess the current population state of C. pica from San Andrés Island, we estimated size structure, sex structure, maturation size, and growth parameters, based on length-frequency data analysis. From September to December 2013, and January to March 2014, we randomly collected 458 individuals at eight representative sites of the rocky shores of the island. We measured the longest diameter of the shell base, determined the sex by the color of the gonad, and thus determined the minimum maturation size. We found, that 80 % of the population consisted of small individuals < 25.5 mm sizes. The sex ratio was 1:1 except in November, where males were more abundant. The minimum size at the beginning of maturity for both sexes was 14.07 mm. The growth parameters of von Bertalanffy: K (0.730 yr-1), L∞ (110.78 mm) and Φ (3.95) were higher when compared to other populations of the Caribbean. The total mortality was 3.39 yr-1, while natural and fishing mortalities were 1.02 yr-1 and 2.36 yr-1, respectively. The maximum annual recruitment pulse was estimated for June, and the maximum exploitation rate for a sustainable yield was between 0.563 and 0.640, when the catch size was greater than 40 mm or 50 mm, respectively. The exploitation rate was estimated in 0.70, suggesting a strong extractive resource pressure. With these results we recommend the closure of the fishery and constant monitoring to promote and the population recovery is verified. Until a monitoring shows that the population recovers on the island.

Genetic characterization of Colombian indigenous sheep / Caracterización genética de ovinos criollos colombianos / Caracterização genética de ovinos crioulos colombianos

Abstract Background: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS ) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement.

Resumen Antecedentes: las razas animales autóctonas son importantes para los agricultores de escasos recursos a causa de su selección natural contra el duro ambiente y su adaptación a condiciones regionales. Sin embargo en Colombia, debido al cruce indiscriminado con razas foráneas y a la falta de control de la reproducción, ha aumentado la consanguinidad en las poblaciones de ovinos criollos y por lo tanto la pérdida en la productividad, lo que supone un gran riesgo para la conservación de genes valiosos. Objetivo: determinar la diversidad genética en razas criollas de ovinos colombianos utilizando análisis por microsatélites. Métodos: se visitaron 43 granjas localizadas en 11 departamentos del país, en las cuales se tomaron muestras de sangre a 362 individuos. Las muestras fueron genotipadas y analizadas para un panel de 10 marcadores microsatélites. Resultados: un total de 134 alelos fueron encontrados (13,4 alelos/locus en promedio), con un rango de heterocigocidad observada y esperada de 0,428 a 0,831 y 0,615 a 0,855, respectivamente, y un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0,742. El Wright F-statistics (FIS) promedio de las razas evaluadas fue 0,107, lo cual sugiere que las razas tienen niveles moderados de consanguinidad. Las ovejas colombianas presentaron un bajo grado de diferenciación genética entre las distintas razas (FST = 0,054) y el análisis de STRUCTURE mostró complejos patrones de mezcla en las razas estudiadas. Conclusión: en términos generales, las ovejas colombianas presentan una alta variabilidad genética lo cual es muy importante para futuros programas de conservación y mejoramiento genético.

Resumo Antecedentes: as raças crioulas, devido a sua seleção natural em ambientes hostis e adaptação às condições regionais, são importantes para os agricultores de poucos recursos econômicos. Porém, na Colômbia, devido ao cruzamento indiscriminado com raças estrangeiras e a falta de controle na reprodução, tem aumentado a consanguinidade nas populações de ovinos crioulos e por tanto tem gerado perda na produtividade, o que faz supor um grande risco para a conservação de genes valiosos. Objetivo: determinar a diversidade genética em raças crioulas colombianas utilizando um painel de 10 marcadores moleculares microssatélites. Métodos: visitaram-se 43 granjas localizadas em 11 departamentos do país, nos quais foram amostrados 362 indivíduos, que foram genotipados e analisados para um painel de 10 marcadores microssatélites. Resultados: um total de 134 alelos foram encontrados (média de 13,4 alelos/locus), com um rango de heterocigocidade observada e esperada de 0,428 a 0,831 e 0,615 a 0,855, respectivamente, e um conteúdo de informação polimórfica (PIC) médio de 0,742. O Wright F-statistics (FIS) médio das raças avaliadas foi de 0,107, o qual sugere que as raças apresentam níveis moderados de consanguinidade. As ovelhas colombianas apresentaram um baixo grau de diferenciação genética entre as diferentes raças (FST = 0,054) e o análise de STRUCTURE mostrou complexos patrões de mistura nas raças estudadas. Conclusão: em termos gerais, as ovelhas colombianas apresentaram uma alta variabilidade genética, o qual é muito importante para futuros programas de conservação e melhoramento genético.

LA PALMA AMARGA (Sabal mauritiiformis, Arecaceae) EN SISTEMAS PRODUCTIVOS DEL CARIBE COLOMBIANO: ESTUDIO DE CASO EN PIOJÓ, ATLÁNTICO / The Bitter Palm (Sabal mauritiiformis, Arecaceae) in Productive Systems of the Colombian Caribbean: A Case Study in Piojó, Atlántico

La palma Sabal mauritiiformis es un recurso importante en el Caribe colombiano debido al uso de sus hojas para techar. Para evaluar el estado de sus poblaciones en Piojó (Atlántico), uno de los municipios más productores de hojas, se estudió la densidad y la estructura poblacional de la palma. Se establecieron 16 parcelas de 0,1 ha, en los tres sistemas de uso de suelo más comunes en la zona: ganadería (6), cultivos (5) y rastrojo (5). Se encontró que la palma amarga constituye un recurso silvestre, muy resistente y capaz de adaptarse a ambientes perturbados pues está incorporada en sistemas productivos de cultivos, rastrojos y ganadería, donde las prácticas de manejo influyen en la densidad y estructura de sus poblaciones. La palma es muy resistente y capaz de adaptarse a ambientes perturbados. El área estudiada incluyó 5349 individuos distribuidos en cuatro categorías de tamaño. Los rastrojos (3620 ± 2808 individuos/hectárea) y los cultivos (5612 ± 3361 ind/ha) presentaron más individuos y mejores estructuras poblacionales que las áreas de ganadería (1488 ± 827 ind/ha), en las cuales se encontraron poblaciones más deterioradas por efecto del pisoteo y el forrajeo. La prevalencia de individuos en algunas clases de tamaño refleja las condiciones de manejo actual e histórico; actividades como el pastoreo o las quemas, sin una apropiada planificación, pueden comprometer el desarrollo de las poblaciones de la palma y la futura disponibilidad del recurso.

The palm Sabal mauritiiformis is an important resource in the Colombian Caribbean, as its leaves are used for thatching. In order to assess the status of its populations in Piojó (Atlántico department), one of the major leaf producers in the region, palm population structure was studied by randomly establishing 16 sample plots of 0.1 ha in the three major use areas where the palm occurs:: pastures (6), crops (5) and fallows (5). We found that the bitter palm is a heavily exploited wild resource and management practices impact population structure. The bitter palm is a resilient species, easily adaptable to disturbed environments. The studied plots included 5349 individuals, distributed in four size categories. Fallows (3620 ± 2808 individuals/ha) and crops (5612 ± 3361 ind/ha) had more individuals and population structures that reflect a better condition than pastures (1488 ± 827 ind/ha), which had a population structure with discontinuous distributions due to trampling and foraging. Prevalence of individuals in certain size classes reflects current and historical management conditions; activities such as grazing or removal of vegetation by burning, without proper planning, can jeopardize the development of populations and future resource availability.

ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD GENÉTICA DEL CERDO DOMÉSTICO EN EL DEPARTAMENTO DE CÓRDOBA (COLOMBIA) UTILIZANDO MARCADORES MICROSATÉLITES / STUDY OF GENETIC DIVERSITY OF THE DOMESTIC PIG IN THE DEPARTMENT OF CÓRDOBA (COLOMBIA) USING MICROSATELLITE MARKERS

En este estudio se analizaron los niveles de diversidad y estructura genética de 161 cerdos domésticos pertenecientes a tres poblaciones del departamento de Córdoba, mediante 20 marcadores microsatélites. Todos los microsatélites utilizados resultaron polimórficos. Para todos los loci, el valor promedio de la heterocigosidad esperada fue mayor al valor promedio de la heterocigosidad observada, lo cual puede sugerir una posible endogamia en el sistema de apareamiento. El índice (0,12 ± 0,08) mostró un 88% de la varianza en las frecuencias alélicas reportadas dentro de cada población y solo el 12% de la varianza atribuible a diferencias entre poblaciones. Los valores de F IS (0,079) y F IT (0,13), indican deficiencia de heterocigotos dentro de cada población y a nivel global. Desviaciones significativas del equilibrio Hardy-Weinberg (p < 0,05) fueron observadas en ocho de los marcadores utilizados. El árbol Neighbor-Joining obtenido reveló que Momil estuvo más estrechamente relacionada con Cereté, mientras Tierralta se mostró más alejada. El análisis de componentes principales (ACoP) genera la individualización geográfica de cada población, siendo distante la población de Tierralta de las poblaciones Momil y Cereté, resultados similares a los obtenidos con la metodología Neighbor-Joining. El programa Structure con un K = 3, confirma la existencia de tres grupos o poblaciones distintas, generándose un patrón filogeográfico observado en la relación entre Momil, Cereté y Tierralta. Es importante señalar que son 3 grupos raciales diferentes, valiosos y deben conservarse.

Diversity and genetic structure of 161 domestic pigs from three populations of the department of Cordoba, were analyzed by means 20 microsatellite markers; all of them were polymorphic microsatellites. The expected average value of heterozygosity was higher than the observed average value for all loci, which may suggest a possible inbreeding mating system. The F ST index (0.12 ± 0.08) showed 88% of variance in allele frequencies reported within each population and only 12% of the variance was attributable to differences between populations. F K values (0.079) and F IT (0.13) indicate heterozygote deficiency within each population and globally. Significant deviations from Hardy-Weinberg balance (p < 0.05) were observed in eight of the markers used. The Neighbor-Joining tree showed than Momil was more closely related with Cerete while Tierralta was further. The main components analysis (ACoP) generates the geographical identification of each population, being more far Tierralta from Momil and Cerete populations, similar results were obtained with the Neighbor-Joining method. The Structure program with K = 3, confirms the existence of three groups or different populations, which generates a phylogeographic pattern observed in the relationship between Momil, Cerete and Tierralta. It is important to note that there are 3 different racial groups, valuable and must be preserved.

Genetic structure of Tupinambis teguixin (Squamata: Teiidae), with emphasis on Venezuelan populations

Tupinambis teguixin, the common tegu, is the only species of the genus found in Venezuela. It is distributed in different bioregions in the Neotropics, some of them separated by geographic barriers that may restrict gene flow among populations. Thus, to assess this possibility, we tested the Paleogeographic hypothesis and the Riverine hypothesis for the divergence among populations. To this end, we evaluated the degree of genetic structuring in six populations of T. teguixin from Venezuela, plus one from Brazil and one from Ecuador. We used two molecular datasets, one with the populations from Venezuela (Venezuela dataset, 1 023 bp) and one including the other two (South America dataset, 665 bp), with 93 and 102 concatenated sequences from cytochrome b and ND4, and 38/37 haplotypes. We used three measures of genetic diversity: nucleotide diversity, haplotype diversity and number of polymorphic sites. Gene flow was estimated with the statistic

Tupinambis teguixin es la única especie registrada para Venezuela. Este teido se encuentra distribuido en diferentes bioregiones del Neotrópico, en algunos casos separadas por barreras geográficas que pueden estar restringiendo el flujo genético entre sus poblaciones. Para evaluar esta posibilidad, pusimos a prueba las Hipótesis Paleogeográfica y la Rivereña. Para ello evaluamos el grado de estructuración genética de seis poblaciones de T. teguixin de Venezuela, una de Brasil y una de Ecuador. Utilizamos dos bases de datos moleculares, una con las poblaciones de Venezuela (Base de datos Venezuela, 1 023 pb) y la segunda incluyendo las otras dos poblaciones (Base de datos Suramérica, 665 pb), con 93 y 102 secuencias concatenadas de citocromo b y ND4, y 38/37 haploti-pos. En cuanto a la metodología, utilizamos tres medidas de diversidad genética: diversidad nucleotídica, diversidad haplotípica y número de sitios polimórficos. Estimamos el flujo genético mediante el estadístico P ST y los valores de F ST pareados. También construimos redes de haplotipos. Los resultados evidencian estructura poblacional, encontrándose (1) un P ST global de 0.83, (2) F ST pareados altos (0.54-0.94), (3) redes de haplotipos con un patrón geográfico definido, cada población con sus haplotipos agrupados (menos Delta), Zulia y Ecuador con redes separadas, y (4) un solo haplotipo compartido entre las poblaciones. Los análisis muestran que la estructura no es producto de la distancia geográfica entre las poblaciones (r = 0.282, p = 0.209), sino un efecto histórico biogeográfico de la Cordillera de Mérida y del río Orinoco (71.19 % variación molecular), como barreras geográficas. Consideramos la población del Zulia una unidad evolutiva significativa y proponemos que las otras poblaciones temporalmente sean consideradas unidades de manejo, hasta tanto se tenga más información. Las poblaciones del Delta y Guri conformarán una sola unidad de manejo por compartir un haplotipo.

Estructura poblacional de la tortuga blanca, Dermatemys mawii Gray (Testudines, Dermatemydidae), en la Laguna El Perú, Petén, Guatemala / Population structure of the white turtle, Central American River Turtle Dermatemys mawii Gray (Testudines, Dermatemydidae) in Laguna El Peru, Peten, Guatemala

La tortuga blanca (Dermatemys mawii Gray) está considerada en peligro de extinción por UICN, y está en el apéndice II de CITES. Hasta la fecha pocos estudios se han realizado sobre la ecología de esta especie, especialmente sobre la estructura poblacional, siendo importante su estudio pues es la única especie sobreviviente de la familia Dermatemydidae. El presente trabajo analiza la estructura poblacional (razón de sexos, estructura de edades) y la abundancia relativa de dicha especie en la laguna El Perú, Petén, Guatemala. Se analizó la estructura mediante la determinación del sexo y clases de edades, y se calculó la abundancia relativa tomando en cuenta el número de individuos capturados por unidad de esfuerzo (metros de trasmallos por horas que estuvo instalado el trasmallo). El trabajo fue realizado de junio 2012 a julio 2013 utilizando el método de captura-marca-recaptura y trampeando por cuatro noches consecutivas cada mes, obteniendo un esfuerzo total de captura de 124,800 hrs/m/ trasmallo. Se capturaron, marcaron y liberaron 121 individuos, de los cuales 70 fueron machos y 51 fueron hembras. La razón de sexos se obtuvo mediante el cociente del total de capturas entre machos y hembras, obteniendo una razón de sexos de 1.37 machos por 1 hembra. Se encontró que cerca del 62% de los individuos eran sub-adultos seguido de un número alto de capturas de adultos (38%) y sin ningún reporte de juveniles. Con los resultados obtenidos se infiere que la laguna El Perú posee una población de tortugas blancas importante para la conservación, además de ser un sitio importante para la anidación, refugio y alimentación de esta especie. Por lo tanto es necesario llevar a cabo estudios a lo largo de varios ciclos anuales completos para poder plantear un diseño de manejo y conservación adecuado que tome en cuenta las fluctuaciones poblacionales

The white turtle (Dermatemys mawii Gray) is considered an endangered species by the IUCN and is listed in the Appendix II of CITES. To this date, few studies have been conducted on the ecology of this species, especially on the population structure, which is important because it is the only surviving species of the family Dermatemydidae. This work analyzes the population structure (sex ratio, age structure) and the relative abundance of this species in the lagoon El Perú, Petén, Guatemala. The structure was analyzed by determining the sex and age classes, and the relative abundance was calculated taking into account the number of individuals caught per unit effort (meters of trammel net per the amount of hours the net trammel was installed). The work was performed from June 2012 to July 2013 using the method of capture-markrecapture and tricking for four consecutive nights each month, obtaining a total of 124,800 hrs/m/trammel net. There were 121 individuals captured, markedand released, of whom 70 were males and 51 were females. The sex ratio was obtained using the quotient of the total captures between males and females, resulting in a sex ratio of 1.37 males to 1 female. We found that about 62% of individuals were sub-adult, followed by a large number of captured adults (38%) and no reports of juveniles. With the obtained results, we conclude that the lagoon Peru has a population of green turtles important for conservation, in addition to being an important nesting and feeding refuge site for this species. Therefore, it is necessary to conduct studies over several complete annual cycles to propose an appropriate management and conservation design that considers the population fluctuation

The stands of Copernicia tectorum (Arecaceae) in the Caribbean lowlands of Colombia: a managed pioneer palm facing river dynamics / Poblaciones de Copernicia tectorum (Arecaceae) en las tierras bajas del Caribe de Colombia: una palma pionera expuesta a la dinámica de un río

Copernicia tectorum is a palm that grows in large populations on seasonally flooded savannas in the Caribbean region of Colombia, where its stems and expanded leaves are used in construction, and its unexpanded leaves are used to make handicrafts. We studied abundance and population structure in 34 plots of 20×10m (0.68 ha) of three localities (Plato, Córdoba and Magangué) at the Mompox Depression, an inner delta formed by the confluence of four large rivers. We recorded growth and mortality of 164 palms of different size classes over 13 months, and additionally we estimated seedling and juvenile mortality in two 10x10m plots within the same sites. Data analysis using Kolgomorov-Smirnov (KS), Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests were made on Statgraphics Plus and SPSS. We related the structure and dynamics of the palm stands to flood intensity. Copernicia tectorum has the fastest leaf production rate recorded for any palm (19-23 leaves/year in subadults and adults), and a short life span of ca. 46 years. The abundance, density and high leaf production rate of this palm offer a great potential for the sustainable use of its unexpanded leaves (especially at Plato, where there are ca. 480ha of palm stands with 300-1 000 individuals/ha), as leaf harvest from subadult and adult individuals does not appear to affect population structure. The palm is a pioneer of the flood plain, and the palm stands at particular sites appear to wax and wane following sedimentation dynamics, in which the species plays in important role. Current population structure and the scarce recruitment of juveniles at the study site suggest that the population is waning in that site. Management actions should be taken to reestablish natural river dynamics at the lagoon complex where the palm grows. Appropriate management of palm stands may contribute to minimize any negative effects of river dynamics.

La palma Copernicia tectorum forma grandes poblaciones en sabanas estacionalmente inundables de la región Caribe de Colombia, donde sus tallos y hojas se utilizan en construcción y sus cogollos para la elaboración de artesanías. Estudiamos la abundancia y la estructura poblacional en 34 parcelas de 20×10m (0.68 ha), en tres localidades (Plato, Córdoba y Magangué) en la Depresión Momposina, un delta interior formado por la confluencia de cuatro grandes ríos. Registramos el crecimiento y la mortalidad de 164 palmas de diferentes clases de tamaño durante 13 meses y estimamos además la mortalidad en plántulas y juveniles en dos parcelas de 10x10m en los mismos sitios. Los análisis se realizaron con las pruebas de Kolgomorov-Smirnov (KS), Kruskal-Wallis y Mann-Whitney en Statgraphics Plus and SPSS. Relacionamos la estructura y dinámica de los palmares con la intensidad de la inundación. Copernicia tectorum tiene la tasa de producción de hojas más rápida registrada hasta ahora para cualquier palma (19-23 hojas por año en subadultos y adultos) y una vida corta de ca. 46 años. La abundancia, densidad y alta tasa de producción de hojas de la palma ofrecen un gran potencial para el uso sostenible de sus cogollos (especialmente en Plato, donde hay unas 480 ha de palmares con 300-1 000 individuos/ha), ya que la cosecha de hojas de palmas adultas y subadultas, parece no afectar la estructura de la población. La palma es una pionera de las llanuras inundables, y los palmares en un sitio particular crecen y se reducen siguiendo la dinámica de sedimentación, en la cual la especie juega un papel importante. La estructura actual de las poblaciones y el escaso reclutamiento en las clases juveniles en el sitio de estudio sugieren que allí la población se está reduciendo. Se deben emprender acciones de manejo que apunten a restablecer la dinámica fluvial natural en los complejos cenagosos en los que crece la palma. A su vez, el manejo apropiado de los palmares ...

Population structure of humpback whales in the western and central South Pacific Ocean as determined by vocal exchange among populations.

For cetaceans, population structure is traditionally determined by molecular genetics or photographically identified individuals. Acoustic data, however, has provided information on movement and population structure with less effort and cost than traditional methods in an array of taxa. Male humpback whales (Megaptera novaeangliae) produce a continually evolving vocal sexual display, or song, that is similar among all males in a population. The rapid cultural transmission (the transfer of information or behavior between conspecifics through social learning) of different versions of this display between distinct but interconnected populations in the western and central South Pacific region presents a unique way to investigate population structure based on the movement dynamics of a song (acoustic) display. Using 11 years of data, we investigated an acoustically based population structure for the region by comparing stereotyped song sequences among populations and years. We used the Levenshtein distance technique to group previously defined populations into (vocally based) clusters based on the overall similarity of their song display in space and time. We identified the following distinct vocal clusters: western cluster, 1 population off eastern Australia; central cluster, populations around New Caledonia, Tonga, and American Samoa; and eastern region, either a single cluster or 2 clusters, one around the Cook Islands and the other off French Polynesia. These results are consistent with the hypothesis that each breeding aggregation represents a distinct population (each occupied a single, terminal node) in a metapopulation, similar to the current understanding of population structure based on genetic and photo-identification studies. However, the central vocal cluster had higher levels of song-sharing among populations than the other clusters, indicating that levels of vocal connectivity varied within the region. Our results demonstrate the utility and value of using culturally transmitted vocal patterns as a way of defining connectivity to infer population structure. We suggest vocal patterns be incorporated by the International Whaling Commission in conjunction with traditional methods in the assessment of structure.

Estructura Poblacional de las Yubartas en el Centro y Occidente del Sur del Océano Pacífico, Determinada por el Intercambio Vocal entre las Poblaciones Resumen La estructura poblacional de los cetáceos se determina tradicionalmente por medio de genética molecular o individuos identificados fotográficamente. Sin embargo, los datos acústicos han proporcionado información sobre el movimiento y la estructura poblacional de una variedad de taxones con menos esfuerzo y menos costo que los métodos tradicionales. Las yubartas macho (Megaptera novaeangliae) producen una demostración vocal sexual, o canto, en continua evolución que es similar entre todos los machos en una población. La transmisión cultural rápida (la transferencia de información o comportamientos entre co-específicos por medio del aprendizaje social) de diferentes versiones de esta demostración entre poblaciones distintas pero interconectadas en el centro y occidente en la región del sur del Pacífico presenta una manera única para investigar la estructura poblacional con base en las dinámicas de movimiento de la demostración del canto (acústico). Al usar once años de datos, con base en la acústica investigamos a una estructura poblacional de la región al comparar secuencias estereotipadas de cantos entre las poblaciones y los años. Usamos la técnica de la distancia Levenshtein para agrupar poblaciones previamente definidas en grupos (con base vocal) basados en la similitud general de su canto en el espacio y el tiempo. Identificamos a los siguientes grupos vocales perceptibles: grupo occidental, una población al este de Australia; grupo central, poblaciones alrededor de Nueva Caledonia, Tonga y Samoa Americana; y región oriental, ya sea un grupo único o dos grupos, uno alrededor de las Islas Cook y el otro cerca de la Polinesia Francesa. Estos resultados son consistentes con la hipótesis de que cada conjunto reproductivo representa a una población distinta (cada una ocupó un nodo terminal único) en una meta-población, similar al entendimiento actual de la estructura poblacional con base en los estudios genéticos y de foto-identificación. Sin embargo, el grupo vocal central tuvo niveles más altos de cantos compartidos entre las poblaciones que en los otros grupos, lo que indica que los niveles de conectividad vocal variaron dentro de la región. Nuestros resultados demuestran la utilidad y el valor de usar patrones vocales transmitidos culturalmente como una forma de definir la conectividad para inferir la estructura poblacional. Sugerimos que los patrones vocales sean incorporados por la Comisión Internacional de Caza de Ballenas en conjunto con los métodos tradicionales de evaluación de la estructura.

VARIACIÓN DEMOGRÁFICA TEMPORAL DE LA TORTUGA DE RÍO CHOCOANA, Rhinoclemmys nasuta (GEOEMYDIDAE), EN ISLA PALMA, BAHÍA MÁLAGA, PACÍFICO DEL VALLE DEL CAUCA / Temporal Variation in Demography of the Chocoan River Turtle, Rhinoclemmys nasuta (Geoemydidae), on Isla Palma, Malaga Bay, Pacific Coast of Valle del Cauca

Pocos estudios demográficos de larga duración han sido realizados en tortugas dulceacuícolas de Suramérica, pese a la necesidad de este tipo de investigación para esclarecer las variaciones naturales y fortalecer procesos de conservación en este grupo particular. En esta investigación se estudió la variación en la demografía de una población de la tortuga de río chocoana (Rhinoclemmys nasuta), a partir de información registrada en una localidad insular del Pacífico colombiano entre 2005 y 2012. En esta localidad se capturaron manualmente tortugas en cinco riachuelos con un área total de 0,4 ha. Se calculó el tamaño poblacional con el método Jolly-Seber en cuatro periodos (2005-06, 2007, 2011 y 2012), y se comparó la estructura poblacional. Se estimó la probabilidad de supervivencia y la probabilidad de captura para machos, hembras y juveniles utilizando el modelo Cormack-Jolly-Seber, y la tasa de crecimiento poblacional con el modelo POPAN. Se evidenciaron aumentos y disminuciones en el tamaño de la población. Se evidenció un aumento significativo del porcentaje de juveniles que hacen parte de la población durante el periodo de estudio. En todos los periodos las hembras dominaron la estructura de sexos de la población. Las variaciones temporales en el tamaño poblacional pueden deberse a cambios naturales en el hábitat o a efectos denso-dependientes. Sin embargo, también pueden corresponder a fluctuaciones normales en los parámetros poblacionales, por lo tanto monitoreos continuos donde se puedan correlacionar factores ambientales y físicos del hábitat podrían permitirnos elucidar a que se deben estas variaciones.

Few long-term demographic studies have been conducted in freshwater turtles of South America despite the need for this type of inquiry to investigate natural variation and strengthen conservation efforts for these species. In this study, we examined variation in demography of the Chocoan River Turtle (Rhinoclemmys nasuta) based on a population from an island locality in the Colombian Pacific region between 2005 and 2012. At this locality we captured turtles by hand in five streams with a total area of 0.4 ha. We calculated population size with the Jolly-Seber method and compared the population structure of four time periods (2005-06, 2007, 2011 and 2012). We calculated the probability of survival and capture probability for males, females and juveniles using the Cormack -Jolly-Seber model and we estimated the rate of population growth with the POPAN model. We found increases and decreases in population size, and a significant increase in the percentage of juveniles in 2011 and 2012. In all periods, females dominated the sex structure of the population. Temporal variation in population size may be due to natural changes in habitat or density-dependent effects. However, it may correspond with normal fluctuations in population parameters, therefore continuous monitoring that can be correlated with environmental and physical factors of the habitat could elucidate the causes of the variation.

Microsatellites loci reveal heterozygosis and population structure in vampire bats (Desmodus rotundus) (Chiroptera: Phyllostomidae) of Mexico / Microsatélites revelan heterocigosidad y estructura poblacional de murciélagos vampiro (Desmodus rotundus) (Quiróptera: Phyllostomidae) de México

A limited number of studies have focused on the population genetic structure of vampire bats (Desmodus rotundus) in America. This medium-sized bat is distributed in tropical areas of the continent with high prevalence in forested livestock areas. The aim of this work was to characterize the vampire population structure and their genetic differentiation. For this, we followed standard methods by which live vampires (caught by mist-netting) and preserved material from scientific collections, were obtained for a total of 15 different locations, ranging from Chihuahua (North) to Quintana Roo (Southeast). Tissue samples were obtained from both live and collected animals, and the genetic differentiation, within and among localities, was assessed by the use of seven microsatellite loci. Our results showed that all loci were polymorphic and no private alleles were detected. High levels of heterozygosis were detected when the proportion of alleles in each locus were compared. Pairwise F ST and R ST detected significant genetic differentiation among individuals from different localities. Our population structure results indicate the presence of eleven clusters, with a high percentage of assigned individuals to some specific collecting site. Rev. Biol. Trop. 62 (2): 659-669. Epub 2014 June 01.

Muy pocos trabajos se han enfocado en el estudio genético de las poblaciones de vampiro (Desmodus rotundus) en América. Este murciélago de tamaño mediano se encuentra distribuido en las áreas tropicales de América, con una gran prevalencia en zonas de ganadería. La recolecta de tejidos se realizó mediante redes de niebla y en con ejemplares de colecciones, estas dan un total de 15 localidades. Mediante el uso de siete microsatellites, nosotros estudiamos la diferenciación genética dentro y entre localidades muestreadas, estas fueron desde Chihuahua en el norte, hasta Quintana Roo en el sureste. Todos los loci fueron polimórficos y no se encontraron alelos privados. Se encontraron altos niveles de heterócigos cuando se compararon la proporción de alelos en cada locus. Comparaciones pareadas de F ST y R ST mostraron una diferenciación genética entre los individuos de las diferentes localidades. Los resultados de estructura genética indican la presencia de once clusters, con un alto porcentaje de asignación de los individuos a las localidades en donde fueron recolectados.

Abundancia y estructura poblacional de Crocodylus acutus (Reptilia: Crocodylidae) en la laguna Palmasola, Oaxaca, México / Population ecology of Crocodylus acutus (Reptilia: Crocodylidae) in Palmasola lagoon, Oaxaca, Mexico

Abundance and population structure are important parameters to evaluate and compare the conservation status of a population over time in a given area. This study describes the population abundance and structure of Crocodylus acutus in Palmasola lagoon, Oaxaca. The field works consisted of night surveys during the new moon phase, between the 21:00 and 24:00h. These were conducted during the dry and wet seasons and counted the number of individuals to obtain population estimates. Recorded encounter rates ranged from 32 to 109.3ind./ km in 40 journeys deployed with an average time of 18 minutes browsing. The estimated population size using the Messel´s model ranged from 32.7 to 93 individuals. For both seasons, there was a marked dominance of subadults, followed by juveniles and to a lesser extent adult individuals, as well as undetermined individuals (i.e. unknown body/size/length), in both seasons. There was also a significant association with mangrove areas (26.1%) by juveniles; the subadults´s individual use of superficial water (22.7%) and mangrove areas (15.7%); meanwhile the adults were observed on superficial water (9.7%). This information contributes to our understanding of the population ecology of C. acutus in the Palmasola lagoon where the estimated population size seems to show higher values when compared to other reports in the country.

La abundancia y estructura poblacional son pará-metros importantes para evaluar y comparar el estatus de conservación de una población a través del tiempo en un área determinada. Este estudio describe la abundancia y estructura poblacional de Crocodylus acutus en la laguna Palmasola, Oaxaca. El trabajo consistió en recorridos nocturnos, entre las 21 y 24h, durante la fase de luna nueva para contabilizar el número de individuos y obtener estimaciones poblacionales. El tamaño poblacional estimado fluctuó de 32.7 a 93 individuos según el modelo utilizado. Las tasas de encuentro registradas fluctuaron de 32 a 109.3 ind/km lineal durante los 40 recorridos efectuados con un tiempo promedio de navegación de 18 minutos. Existió una marcada dominancia de la clase III (subadultos), seguido por la clase II y en menor proporción las clases IV y V, así como aquellos individuos en los que no se pudo determinar el tamaño corporal, en ambas épocas del año. Mientras tanto, los individuos juveniles (Clase II) se observaron en mayor proporción asociados al manglar que cubre las orillas del cuerpo de agua (26.1%), los individuos subadultos (Clase III) a menudo se observaron sobre el espejo de agua sin vegetación flotante (22.7%) y entre el manglar que cubre las orillas del cuerpo de agua (15.7%), mientras que los ejemplares adultos se observaron con mayor frecuencia sobre el espejo de agua sin vegetación flotante (9.7%). Con la presente información se contribuye al conocimiento de la ecología poblacional de C. acutus en la laguna Palmasola donde el tamaño poblacional estimado parece mostrar valores altos con respecto a lo reportado en otros estados de la República Mexicana.

Dinámica poblacional de Donax denticulatus (Bivalvia: Donacidae) en playa Carenero, costa sur oriental de Cuba / Population dynamic of Donax denticulatus (Bivalvia: Donacidae) at Carenero Beach, Southeastern Cuba

Bivalve molluscs of Donax genus are a very important component of macro-invertebrate assemblages of sandy beaches, and some species are of commercial value in different countries. Although in Cuba Donax denticulatus is not a currently exploited species, the information concerning a stock assessment is a basic step for future use of this resource. With the aim to generate new data on this species structure, growth and secondary production, monthly samples of D. denticulatus were taken from a beach of the Southeastern coast of Cuba, from February to December 2008. Samples were taken from four stations located along the beach; three strata were marked (P1, P2 and P3) per station across the intertidal zone. Three replicated samples of sediments were taken from each stratum with a 0.025m2 PVC core and were posteriorly sieved with a 1mm mesh. Histograms of shell length were constructed based on 1mm intervals and growth parameters were estimated using ELEFAN I routine of FISAT. Mean density ranged from 146.67-855.55ind./m² and no differences were found among months (ANOVA, p>0.05) but among strata (Scheffé, p<0.05). An association of recruits, young and adults abundances with the strata (X², p<0.01) was found. Most of the recruits were found in the upper strata while young and adult individuals were abundant in the mid-lower strata. Size frequency histograms of this population showed recruitment between March-June. Growth parameters estimated by Von Bertalanffy were L∞=27.5mm and K=1.5/year; and the life spam was estimated in 1.5 years. Using the length-converted catch curve, the mortality rate (Z) was estimated in 4.97/year. Based in terms of Ash free dry mass (AFDM), mean biomass was estimated in 0.47g/m².year and the somatic production in 12.4g/m².year. The renewal rate (P/B) estimated for this population was 26.38, the highest among other Donax populations. High densities, fast growth and high somatic production indicate that this population can be exploited for fishing purposes for which some management measures are proposed.

Con el objetivo de aportar información sobre la estructura poblacional, crecimiento y producción secundaria de una población de D. denticulatus, se tomaron muestras mensuales desde febrero a diciembre 2008, en una playa de la costa sur oriental de Cuba. Las muestras se tomaron con un cilindro de PVC de 0.025m² en cuatro estaciones ubicadas a lo largo de la playa y en cada estación se delimitaron tres estratos (P1, P2 y P3) en la zona intermareal. No se encontró diferencias en la densidad entre los meses pero sí entre los estratos. Existe asociación en la abundancia de reclutas, jóvenes y adultos entre estratos. Existe un reclutamiento unimodal entre marzo y junio. Los parámetros de crecimiento fueron L∞=27.5mm y K=1.5/año. El tiempo de vida teórico fue de 1.5 años y la tasa de mortalidad (Z) se estimó en 4.97/año. En términos de peso seco libre de cenizas (PSLC) se estimó la biomasa media en 0.47g/m2.año y la producción somática en 12.4g/m².año, con una tasa de renovación (P/B) de 26.38. La evaluación de la población indica que esta tiene potencial para ser utilizada como carnada o para el consumo.

Population biology of the mangrove crab Ucides cordatus (Decapoda: Ucididae) in an estuary from semiarid Northeastern Brazil / Biología poblacional del cangrejo de manglar Ucides cordatus (Decapoda: Ucididae) en un estuario tropical semiárido

The mangrove crab Ucides cordatus is an important resource of estuarine regions along the Brazilian coast. U. cordatus is distributed from Florida, USA, to the coast of Santa Catarina, Brazil. The species plays an important role in processing leaf litter in the mangroves, which optimizes the processes of energy transfer and nutrient cycling, and is considered a keystone species in the ecosystem. Population declines have been reported in different parts of the Brazilian coast. In the present study we evaluated aspects of the population structure, sex ratio and size at morphological sexual maturity. We analyzed 977 specimens collected monthly over 24 months (2010-2012), in a mangrove of the Jaguaribe River, in the municipality of Aracati on the East coast of Ceará state, Northeastern Brazil. The study area has a mild semiarid tropical climate, with mean temperatures between 26 and 28oC. The area is located within the eco-region of the semiarid Northeast coast, where mangroves occur in small areas and estuaries are affected by mesomareal regimes. The population structure was evaluated by the frequency distribution of size classes in each month, and the overall sex ratio was analyzed using the chi-square test. Size at morphological sexual maturity was estimated based on the allometry of the cheliped of the males and the abdomen width of the females, using the program REGRANS. The size-frequency distribution was unimodal in both sexes. The overall sex ratio (M: F) (1:0.6) was significantly different from 1:1. Analysis of the sex ratio by size class showed that the proportion of males increased significantly from size class 55-60mm upward, and this pattern persisted in the larger size classes. In the smaller size classes the sex ratio did not differ from 1:1. The size at morphological sexual maturity was estimated at a carapace width (CW) of 52mm and 45mm for males and females, respectively. Analysis of the population parameters indicated that ...

El cangrejo Ucides cordatus es un importante recurso pesquero de las regiones de estuarios a lo largo de la costa brasileña. Disminuciones de las poblaciones han sido reportadas en diferentes regiones del país. El presente estudio evaluó aspectos de la estructura poblacional, proporción sexual y talla en la madurez sexual. Se analizó un total de 977 ejemplares capturados mensualmente, por 24 meses, en lo manglar del río Jaguaribe, en el municipio de Aracati, en la costa este de Ceará, nordeste del Brasil. El área de estudio tiene un clima semiárido tropical, con temperaturas medias entre los 26 y 28°C. La estructura poblacional fue evaluada para determinar la distribución de frecuencia de clases de talla. Para analizar diferencias significativas respecto a la proporción sexual se aplicó la prueba Chi-quadrado. La talla de la madurez sexual morfológica fue estimada con base en la alometría del propodito del quelípedo de los machos y de la anchura del abdomen de las hembras, utilizando el programa REGRANS. La distribución de frecuencia de talla fue unimodal para los dos sexos. La proporción sexual total (M:H)(1:0.6), se desvió significativamente de la igualdad. El análisis de la proporción entre sexos, relativo a las clases de tallas mostró que la proporción de machos se tornó significativamente más alta desde la clase de 55-60mm de talla, y este se mantuvo en las clases de talla más grande. No obstante, en las clases más pequeñas la proporción entre los sexos no fue distinta de 1:1. La talla de la madurez sexual morfológica fue de 52mm de ancho del caparazón y 45mm para los machos y hembras, respectivamente. Los resultados de los atributos analizados permitieran deducir que la población de U. cordatus en el manglar del río Jaguaribe se encuentran en una situación de estabilidad. Sin embargo, el monitoreo constante de la población es necesario para detectar alteraciones en los atributos de la población que puedan afectar esta situación de estabilidad.

The effect of highly variable topography on the spatial distribution of Aniba perutilis (Lauraceae) in the Colombian Andes

Topography is a factor that can significantly affect the diversity and the distribution of trees species in tropical forests. Aniba perutilis, a timber species listed as vulnerable to extinction, is widely distributed in Andean forest fragments, especially in those with highly variable topography. Based on field surveys and logistic regression analyses, we studied the population structure and the effect of highly variable topography on the spatial distribution of this tree in three protected forest fragments in the central Andes of Colombia. Individuals of A. perutilis were mainly found on mountain ridges and hills with gentle slopes; no individuals were found in valleys. Using a species distribution model with presence/absence data, we showed that the available habitat for A. perutilis is significantly smaller than the extension of the fragments and much smaller than the extension of the currently protected areas. Our results have important implications for the conservation of A. perutilis and likely for other threatened Andean tree species, which can also have locally restricted distributions due to highly variable local topography.

La topografía es un factor que puede afectar considerablemente la diversidad y la distribución de las especies de árboles tropicales. Aniba perutilis, una especie de árbol maderable vulnerable a la extinción, está ampliamente distribuida en fragmentos de bosques andinos, especialmente en aquellos con topografía altamente variable. A partir de trabajo de campo y análisis de regresión logística, estudiamos la estructura de la población y los efectos de la topografía sobre la distribución espacial de este árbol en tres fragmentos de bosque en la cordillera central de Colombia que actualmente se encuentran protegidos. Los individuos de A. perutilis se encontraron principalmente en los filos de montaña y colinas con gradientes topográficos suaves; no se encontraron individuos en los valles. A partir de un modelo de distribución de especies usando datos de presencia/ausencia, mostramos que el hábitat disponible para A. perutilis es considerablemente más pequeño que la extensión de los fragmentos y mucho más reducido que la extensión actual de las áreas protegidas. Nuestros resultados tienen implicaciones importantes para la conservación de A. perutilis y probablemente otras especies de árboles andinos amenazados, los cuales pueden estar restringidos de forma similar debido a la variabilidad topográfica local.